Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rpl17Q9CPR4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rpl17Q9CPR4 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rpl17Q9CPR4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
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