Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gins4Q99LZ3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms