Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec3Q99J72 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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