Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rnf144aQ925F3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms