Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gtf3c1Q8K284 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gtf3c1Q8K284 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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