Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Ttc28Q80XJ3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc28Q80XJ3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc28Q80XJ3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc28Q80XJ3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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