Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ttc29Q80VM3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ttc29Q80VM3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ttc29Q80VM3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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