Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sbf1Q6ZPE2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms