Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Naa38-204ENSMUST00000144531 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Coa4-202ENSMUST00000120454 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
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NipblQ6KCD5 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
NipblQ6KCD5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
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