Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CltbQ6IRU5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CltbQ6IRU5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms