Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cd47Q61735 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Cd47Q61735 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cd47Q61735 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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