Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sin3aQ60520 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms