Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trim71Q1PSW8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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