Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxd13P70217 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms