Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ACTA1P68133 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms