Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP53609 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms