Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col18a1P39061 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms