Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Apoc1P34928 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms