Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pde6aP27664 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pde6aP27664 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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