Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
CrxO54751 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nckap5-208ENSMUST00000161954 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
CrxO54751 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms