Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem200cJ3QK46 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms