Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zfp988F6VKC7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms