Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms