Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rrn3B2RS91 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rrn3B2RS91 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rrn3B2RS91 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rrn3B2RS91 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rrn3B2RS91 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rrn3B2RS91 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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