Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ClpxQ9JHS4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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