Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irx6Q9ER75 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Irx6Q9ER75 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Irx6Q9ER75 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms