Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bap18Q9DCT6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms