Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MsraQ9D6Y7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms