Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ribc2Q9D4Q1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms