Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tmed11Q9D2R4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.6 ms