Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp1b4Q99ME6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms