Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Srsf4Q8VE97 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms