Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rexo1Q7TT28 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rexo1Q7TT28 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms