Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tmeff1Q6PFE7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms