Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
JrkQ60976 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
JrkQ60976 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
JrkQ60976 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms