Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Ulk3Q3U3Q1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ulk3Q3U3Q1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ulk3Q3U3Q1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.6 ms