Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Aplp1Q03157 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms