Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb4Q02738 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms