Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Grin2cQ01098 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms