Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ube2kP61087 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms