Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Gm20795J3QP49 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms