Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Usp9yF8VPU6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Usp9yF8VPU6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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