Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Homer1Q9Z2Y3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Homer1Q9Z2Y3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Homer1Q9Z2Y3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms