Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccne2Q9Z238 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccne2Q9Z238 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccne2Q9Z238 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms