Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lgr5Q9Z1P4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lgr5Q9Z1P4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lgr5Q9Z1P4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms