Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms