Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cd97Q9Z0M6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cd97Q9Z0M6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms