Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clcn5Q9WVD4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcn5Q9WVD4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms