Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nme4Q9WV84 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme4Q9WV84 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme4Q9WV84 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms