Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a4Q9WV27 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a4Q9WV27 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a4Q9WV27 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms